Отсутствие влияния варианта p.Arg230His (rs749628307) в гене VCL на течение гипертрофической кардиомиопатии в русской семье носителей патогенного варианта p.Gln1233Ter (rs397516037) в гене MYBPC3
https://doi.org/10.18087/cardio.2023.3.n1937
Аннотация
Цель Определение специфических клинических характеристик, вызванных комбинацией патогенного варианта rs397516037 в гене миозинсвязывающего белка С (MYBPC3) и полиморфного варианта rs749628307 в гене белка винкулина (VCL), в русской семье носителей и значение вклада полиморфного варианта rs749628307 в гене VCL в развитие гипертрофической кардиомиопатии (ГКМП).
Материал и методы Исследуемая семья включала одного здорового испытуемого и 3 пациентов с ГКМП. Осуществлен таргетный анализ экзома пробанда. Проведено структурное выравнивание обеих форм белка винкулина (VCL): канонической формы и несущей замену p.Arg230His.
Результаты Патогенный вариант rs397516037 и потенциально патогенный вариант rs749628307 были обнаружены у пробанда и нескольких членов его семьи. Структурное выравнивание подтвердило, что вариант rs749628307 не изменяет значительно структуру белка и не может приводить к нарушению или утрате его функции.
Заключение Результаты нашего исследования демонстрируют, что, вероятно, вариант rs749628307 в гене VCL не изменяет патогенетически значимо структуру белка, не влияет на тяжесть и форму клинических проявлений ГКМП и, следовательно, не может считаться патогенным.
Ключевые слова
Об авторах
Е. В. ФилатоваРоссия
старший научный сотрудник Лаборатории молекулярной генетики наследственных болезней
Н. С. Крылова
Россия
доцент кафедры общей терапии ФДПО
А. Л. Класс
Россия
лаборант-исследователь Курчатовского геномного центра
Е. А. Ковалевская
Россия
заведующая кардиологическим отделением
М. Ю. Маслова
Россия
ассистент кафедры общей терапии ФДПО
М. И. Шадрина
Россия
ведущий научный сотрудник Лаборатории молекулярной генетики наследственных болезней
Н. Г. Потешкина
Россия
заведующая кафедрой общей терапии ФДПО
П. А. Сломинский
Россия
заведующий Лабораторией молекулярной генетики наследственных болезней
Список литературы
1. Semsarian C, Ingles J, Maron MS, Maron BJ. New Perspectives on the Prevalence of Hypertrophic Cardiomyopathy. Journal of the American College of Cardiology. 2015;65(12):1249–54. DOI: 10.1016/j.jacc.2015.01.019
2. Maron BJ. Hypertrophic Cardiomyopathy: A Systematic Review. JAMA. 2002;287(10):1308–20. DOI: 10.1001/jama.287.10.1308
3. Maron BJ, Maron MS. Hypertrophic cardiomyopathy. Lancet. 2013;381(9862):242–55. DOI: 10.1016/S0140-6736(12)60397-3
4. Greaves SC, Roche AH, Neutze JM, Whitlock RM, Veale AM. Inheritance of hypertrophic cardiomyopathy: a cross sectional and M mode echocardiographic study of 50 families. Heart. 1987;58(3):259–66. DOI: 10.1136/hrt.58.3.259
5. Ho CY, Charron P, Richard P, Girolami F, Van Spaendonck-Zwarts KY, Pinto Y. Genetic advances in sarcomeric cardiomyopathies: state of the art. Cardiovascular Research. 2015;105(4):397–408. DOI: 10.1093/cvr/cvv025
6. Maron BJ, Maron MS, Semsarian C. Genetics of Hypertrophic Cardiomyopathy After 20 Years: clinical perspectives. Journal of the American College of Cardiology. 2012;60(8):705–15. DOI: 10.1016/j.jacc.2012.02.068
7. Watkins H, Anan R, Coviello DA, Spirito P, Seidman JG, Seidman CE. A De Novo Mutation in α-Tropomyosin That Causes Hypertrophic Cardiomyopathy. Circulation. 1995;91(9):2302–5. DOI: 10.1161/01.CIR.91.9.2302
8. Branzi A, Romeo G, Specchia S, Lolli C, Binetti G, Devoto M et al. Genetic heterogeneity of hypertrophic cardiomyopathy. International Journal of Cardiology. 1985;7(2):129–33. DOI: 10.1016/0167-5273(85)90352-3
9. Hagen CM, Aidt FH, Havndrup O, Hedley PL, Jensen MK, Kanters JK et al. Private Mitochondrial DNA Variants in Danish Patients with Hypertrophic Cardiomyopathy. PLOS ONE. 2015;10(4):e0124540. DOI: 10.1371/journal.pone.0124540
10. Hartmannova H, Kubanek M, Sramko M, Piherova L, Noskova L, Hodanova K et al. Isolated X-Linked Hypertrophic Cardiomyopathy Caused by a Novel Mutation of the Four-and-a-Half LIM Domain 1 Gene. Circulation: Cardiovascular Genetics. 2013;6(6):543–51. DOI: 10.1161/CIRCGENETICS.113.000245
11. Santorelli FM, Tanji K, Manta P, Casali C, Krishna S, Hays AP et al. Maternally Inherited Cardiomyopathy: An Atypical Presentation of the mtDNA 12S rRNA Gene A1555G Mutation. The American Journal of Human Genetics. 1999;64(1):295–300. DOI: 10.1086/302188
12. Das K J, Ingles J, Bagnall RD, Semsarian C. Determining pathogenicity of genetic variants in hypertrophic cardiomyopathy: importance of periodic reassessment. Genetics in Medicine. 2014;16(4):286–93. DOI: 10.1038/gim.2013.138
13. Erdmann J, Raible J, Maki-Abadi J, Hammann J, Wollnik B, Frantz E et al. Spectrum of clinical phenotypes and gene variants in cardiac myosin-binding protein C mutation carriers with hypertrophic cardiomyopathy. Journal of the American College of Cardiology. 2001;38(2):322–30. DOI: 10.1016/S0735-1097(01)01387-0
14. Richard P, Charron P, Carrier L, Ledeuil C, Cheav T, Pichereau C et al. Hypertrophic Cardiomyopathy: Distribution of Disease Genes, Spectrum of Mutations, and Implications for a Molecular Diagnosis Strategy. Circulation. 2003;107(17):2227–32. DOI: 10.1161/01.CIR.0000066323.15244.54
15. Van Driest SL, Vasile VC, Ommen SR, Will ML, Tajik AJ, Gersh BJ et al. Myosin binding protein C mutations and compound heterozygosity in hypertrophic cardiomyopathy. Journal of the American College of Cardiology. 2004;44(9):1903–10. DOI: 10.1016/j.jacc.2004.07.045
16. Cecconi M, Parodi MI, Formisano F, Spirito P, Autore C, Musumeci MB et al. Targeted next-generation sequencing helps to decipher the genetic and phenotypic heterogeneity of hypertrophic cardiomyopathy. International Journal of Molecular Medicine. 2016;38(4):1111–24. DOI: 10.3892/ijmm.2016.2732
17. Ehlermann P, Weichenhan D, Zehelein J, Steen H, Pribe R, Zeller R et al. Adverse events in families with hypertrophic or dilated cardiomyopathy and mutations in the MYBPC3gene. BMC Medical Genetics. 2008;9(1):95. DOI: 10.1186/1471-2350-9-95
18. Fokstuen S, Lyle R, Munoz A, Gehrig C, Lerch R, Perrot A et al. A DNA resequencing array for pathogenic mutation detection in hypertrophic cardiomyopathy. Human Mutation. 2008;29(6):879–85. DOI: 10.1002/humu.20749
19. Ingles J, Doolan A, Chiu C, Seidman J, Seidman C, Semsarian C. Compound and double mutations in patients with hypertrophic cardiomyopathy: implications for genetic testing and counselling. Journal of Medical Genetics. 2005;42(10):e59–e59. DOI: 10.1136/jmg.2005.033886
20. Kapplinger JD, Landstrom AP, Bos JM, Salisbury BA, Callis TE, Ackerman MJ. Distinguishing Hypertrophic Cardiomyopathy-Associated Mutations from Background Genetic Noise. Journal of Cardiovascular Translational Research. 2014;7(3):347–61. DOI: 10.1007/s12265-014-9542-z
21. Tóth T, Nagy V, Faludi R, Csanády M, Nemes A, Simor T et al. The Gln1233ter mutation of the myosin binding protein C gene: Causative mutation or innocent polymorphism in patients with hypertrophic cardiomyopathy? International Journal of Cardiology. 2011;153(2):216–9. DOI: 10.1016/j.ijcard.2011.09.062
22. Zeller R, Ivandic BT, Ehlermann P, Mücke O, Zugck C, Remppis A et al. Large-scale mutation screening in patients with dilated or hypertrophic cardiomyopathy: a pilot study using DGGE. Journal of Molecular Medicine. 2006;84(8):682–91. DOI: 10.1007/s00109-006-0056-2
23. Filatova EV, Krylova NS, Vlasov IN, Maslova MS, Poteshkina NG, Slominsky PA et al. Targeted exome analysis of Russian patients with hypertrophic cardiomyopathy. Molecular Genetics & Genomic Medicine. 2021;9(11):e1808. DOI: 10.1002/mgg3.1808
24. Zhang Y. I-TASSER: Fully automated protein structure prediction in CASP8. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 2009;77(S9(Suppl 9)):100–13. DOI: 10.1002/prot.22588
25. Yang J, Zhang Y. I-TASSER server: new development for protein structure and function predictions. Nucleic Acids Research. 2015;43(W1):W174–81. DOI: 10.1093/nar/gkv342
26. Roy A, Yang J, Zhang Y. COFACTOR: an accurate comparative algorithm for structure-based protein function annotation. Nucleic Acids Research. 2012;40(W1):W471–7. DOI: 10.1093/nar/gks372
27. Rehm HL, Berg JS, Brooks LD, Bustamante CD, Evans JP, Landrum MJ et al. ClinGen – The Clinical Genome Resource. New England Journal of Medicine. 2015;372(23):2235–42. DOI: 10.1056/NEJMsr1406261
28. Richards S, Aziz N, Bale S, Bick D, Das S, Gastier-Foster J et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genetics in Medicine. 2015;17(5):405–24. DOI: 10.1038/gim.2015.30
Рецензия
Для цитирования:
Филатова Е.В., Крылова Н.С., Класс А.Л., Ковалевская Е.А., Маслова М.Ю., Шадрина М.И., Потешкина Н.Г., Сломинский П.А. Отсутствие влияния варианта p.Arg230His (rs749628307) в гене VCL на течение гипертрофической кардиомиопатии в русской семье носителей патогенного варианта p.Gln1233Ter (rs397516037) в гене MYBPC3. Кардиология. 2023;63(3):28-35. https://doi.org/10.18087/cardio.2023.3.n1937
For citation:
Filatova E.V., Krylova N.S., Klass A.L., Kovalevskaya E.A., Maslova M.Yu., Shadrina M.I., Poteshkina N.G., Slominsky P.A. No Effect of the p.Arg230His Variant Of The VCL Protein on the Course of the Hypertrophic Cardiomyopathy In Russian Family Carrying The p.Gln1233Ter Pathogenic Variant In The MYBPC3 Gene. Kardiologiia. 2023;63(3):28-35. https://doi.org/10.18087/cardio.2023.3.n1937